Struktur organisasi Kantor Imigrasi Kelas II Non TPI Blitar meliputi Kakanim Sebagai Kepala Kantor Dibantu Oleh Subbagian Tata Usaha, Seksi Lalu Lintas dan Izin Tinggal Keimigrasian, Seksi Teknologi Informasi dan Komunikasi Keimigrasian, Seksi Intelijen dan Penindakan Keimigrasian.